İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesi, 21.07.2010 tarih ve 27648 sayılı Resmi Gazete'de yayımlanan 6005 Sayılı “Yüksek Öğretim Kurumları Teşkilatı Kanunu ile Bazı Kanun ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun” ile 10 fakülte, 3 enstitü ve 1 yüksekokul olarak kurulmuş, bilimsel özerkliğe ve kamu tüzel kişiliğine haiz, özel bütçeli bir kuruluştur. İzmir Kâtip Çelebi Üniversitesinin ilk Rektörü 09.12.2010 ve 12.09.2017 tarihleri arasında görev yapan Prof. Dr. Galip AKHAN'dır.
Üniversite Rektörlüğü, 10.12.2010 tarihinden itibaren Sağlık Bakanlığı'na bağlı İzmir Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde hizmet sunmaya başlamış; Nisan 2011'de Çiğli Belediyesi Ek Hizmet Binasında hizmet vermeye devam etmiştir. Eylül 2011'de ise Balatçık Mahallesinde bulunan Çiğli Ana Yerleşkesine taşınmıştır. İzmir’in dördüncü devlet üniversitesi olarak kurulan İKÇÜ, adını 17’nci yüzyıl Osmanlı bilim insanı Kâtip Çelebi’den almaktadır. İlk öğrecilerini 2011-2012 eğitim öğretim yılında kabul eden İKÇÜ'de mevcut durumda 13 fakülte, 3 enstitü, 1 yüksekokul, 2 meslek yüksekokulu, 21 uygulama ve araştırma merkezi ve 7 koordinatörlük bulunmaktadır. İKÇÜ, iki ayrı yerleşkede faaliyetlerini sürdürmektedir; Çiğli Merkez Yerleşkesi yanında Çiğli Aydınlıkevler’de de sağlık yerleşkesi bulunmaktadır. Üniversite Rektörlüğüne 09.04.2018 tarihinde Prof. Dr. Saffet Köse atanmıştır.